With @benoitevol.bsky.social, we developed our own strategy to properly estimate π (e.g. doi.org/10.1016/j.cu...) and I extended it to variable ploidy (doi.org/10.1093/gene...). But it's clearly not as user-friendly & computationally efficient as pixy for similar results ➡️Use pixy, forget VCFtools!😉

😍 pixy 😍 - "[...] implementations of new estimators of Watterson's θ and Tajima's D that are unbiased with respect to missing data. - [...] support for arbitrary ploidy and multiallelic sites. - [...] optimizations, including multicore execution" REPEAT AFTER ME: There is no reason not to use Pixy.

Back in Angers, my hometown, after a nice work week in Tours for the #ECE2026Tours and a 4-hour trip along the Loire to visit the gardens of the Villandry castle and my favorite rose collection (Roseraie Loubert) before to arrive in Angers.

Today at lunch we celebrated Maëva Gabrielli's lattest paper with the few remaining Toulouse-based members of the Zobo team over a delicious rougail sausage! Thinking of our Zobo team collaborators on this paper elsewhere in Europe @borjamila.bsky.social @benoitevol.bsky.social @crouxevo.bsky.social

The museum of Toulouse and its botanical garden, one of my favorite places in Toulouse. Here some picts during yesterday's European night of museums!

Fin du séminaire des doctorants du département de génétique animale 2026. Bravo à nos représentantes de l'équipe, Ivalda et Julie qui ont représentées les activitéa de l'équipe BeeGEES, avec le prix de la meilleure présentation pour Julie, le jour du World Bee Day.

C'est parti pour la première mission montpellieraine de l'année...

😍

Excited to share our latest preprint! @mheuertz.bsky.social & I just completed a review covering methods and empirical studies on adaptive introgression in a climate context. We likely missed a few refs & ideas, so your feedback is highly welcome (ideally by email)! Preprint➡️ doi.org/10.32942/X2B...

Formation à la dégustation de miels, de bon samedi matin. 🍯💛🧡🤎

End of a very intense week in Roscoff with both the Jacques Monod conference #cjm25 on speciation and the annual in-person meeting of our ANR-FWF RadiaSpe project. Many thanks to all the organisators of the conference, including Nick Barton & @crouxevo.bsky.social.

Surprising plant diversity observed today at the botanical garden in Roscoff, Brittany (one of the wettest places in France!) during the mid-conference break of the Jacques Monod conference #cjm25 on speciation.

What a nice start to the Jacques Monod conference #cjm25 on speciation in Roscoff, Britany. What an inspiring lineup of talks and scientists. Even the weather is remarkably welcoming, for now, at least. 🤩

Stage bioinfo (niveau M2) sur le centre INRAE Occitanie-Toulouse dans le cadre d'un projet entre BeeGEES (GenPhySE) et @bioinfo-genotoul.bsky.social (MIAT) sur la métagénomique fonctionnelle appliquée aux micro-organismes associés aux miels 🍯🐝 🧬🧑‍💻 + d'infos: thibaultleroyfr.github.io/pdf/Proposit...

Excellent working week in Aussois for the #SSMPG2025. Many thanks to Thibaut Capblancq and Olivier François for the organization of this summer school, as well as all the instructors and participants for the nice discussions. #popgen #GEA #GenomicOffset

Le mariage des roses d'Occident et d'Orient au XIXe siècle: pour le meilleur et pour le pire? theconversation.com/comment-le-c... Petit article de vulgarisation pour The Conversation de nos recherches récentes sur l'histoire de la sélection des rosiers au XIXe! Alors... tout serait-il si rose? 🌹🧬❤️

24h du Mans roller en solo. Enorme merci à mes collègues de #UMRGenPhySe (équipe ALIEN) pour cette magnifique molécule d'ADN sur mon casque en référence à mon nom d'quipe (bien que je sois tout seul!) "Merci Rosalind" pour parler de science et aussi d'effet matilda. Maintenant place à la course!

Un site hétérozygote

Fin du colloque INRAE Genomics. Plein de présentations et de temps de discussion très intéressants, dans un cadre auvergnat sympa.

Jour 2. Plus de 300 personnes pour parler éco-anxiété.

Près de 700 participants à ce webinaire. Je crois que le sujet intéresse de plus en plus le personnel de nos laboratoires, en particulier dans nos métiers de chercheuses et chercheurs devenus complètement délirants.

Soutenance d'HDR de Yann Bourgeois. @bourgeoisyann.bsky.social 👏👏👏

My small contribution to the discussion on scientific ethics, by highlighting a typical case of citation bias. Here is the citation trajectory I retrieved for the Monroe et al. paper, despite multiple reanalyses revealing critical flaws. 😔 Feel free to be as depressed as I am right now! 😉

20h15, c'est la fin de ce tronche en live et plus globalement de ce #RECTlse25. Que du bonheur comme toujours ! Content de revenir demain à la recherche avec tous ces éléments de réflexion sur le monde académique.

Pour finir ce magnifique #RECtlse25, un tronche en live (la tronche en biais) de 2 heures sur les libertés académiques, dans le contexte de Stand Up for Science, et les attaques généralisées contre les sciences, aux Etats-Unis, en France et dans le reste de l'Europe, ainsi qu'ailleurs dans monde...

Théories selon lesquelles les Schtroumpfs correspondrait à un village communiste. Les joies d'internet quand même! 😂

Les interprétations psychologiques dans beaucoup de dessins animés.

Tromperies, complots, jeux de pouvoir, dans un très grand nombre de dessins animés.

Nouvelles catégories : les théories associées au panaromal X-Files (1993 à 2002): on retrouve toutes les théories du complot dans cette série. I want to believe. Affiche du biais de préférence dans le film.

Prochaine conf': complots dans les films américains et les dessins animés.